Programa de Pós Graduação em Física (PPGF)

Walter Filgueira de Azevedo Junior

"Let the light of science end the darkness of denialism." DOI:10.2174/092986732838211207154549. Dr. Walter F. de Azevedo, Jr. earned a BSc in Physics (1990), an MSc in Applied Physics (1992), and a DSc in Applied Physics (1997) from the University of São Paulo (Brazil). Dr. Azevedo worked under the supervision of Prof. Yvonne Primerano Mascarenhas (University of São Paulo) and Prof. Sung-Hou Kim (University of California, Berkeley) on a split Doctoral program with a fellowship from the Brazilian Research Council (CNPq). During the first two years of his stay at Berkeley, he was under a CNPq fellowship (1993-95). Due to his performance during these first years, Prof. S.-H. Kim hired him as Visiting Researcher for the Department of Chemistry, University of California at Berkeley (1995-96). The work developed at Berkeley resulted in his thesis about the structure of Cyclin-Dependent Kinase 2 in complex with inhibitors (PDB code: 2A4L) (https://www.rcsb.org/structure/2A4L) (de Azevedo et al., 1996)(https://doi.org/10.1073/pnas.93.7.2735); (de Azevedo et al., 1997)(https://doi.org/10.1111/j.1432-1033.1997.0518a.x). Dr. Azevedo is the first author of both papers, and these publications gathered more than 1,000 citations on the Web of Science (https://www.webofscience.com/wos/author/record/581112). During 1997-98 he had a postdoc position at São Paulo State University (Unesp) with a Fapesp fellowship (https://bv.fapesp.br/pt/bolsas/75932/determinacao-de-estruturas-de-proteinas-por-tecnicas-de-difracao-de-raios-x/). He holds a habilitation degree in Physics (livre-docência) from the São Paulo State University (Unesp)(2004). In 1998, Dr. Azevedo participated in a research project with NASA that sent proteins to crystallize in a microgravity environment onboard the Space Shuttle Discovery (STS-95). This research had coverage of Brazilian TV networks (https://www.youtube.com/watch?v=N9IFiQNY8mE). In 2019, he published a book entitled "Docking Screens for Drug Discovery.". This book sold 59,000 copies (June 2025) with over 2 million dollars in sales (https://link.springer.com/book/10.1007/978-1-4939-9752-7). In 2020, the Journal Plos Biology ranked Dr. Azevedo among the most influential researchers in the world (https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000918). Dr. Azevedo works as an editor of several journals. Among them, he is the frontiers section editor (Bioinformatics/Biophysics) for the Current Drug Targets (https://benthamscience.com/journals/current-drug-targets/editorial-board/#top), section editor (Bioinformatics in Drug Design and Discovery) for the Current Medicinal Chemistry (https://benthamscience.com/journals/current-medicinal-chemistry/editorial-board/#top), review editor for Frontiers in Chemistry (https://loop.frontiersin.org/people/1278875/overview), associate editor for Exploration of Drug Science, member of the editorial board of Molecular Diversity (https://www.springer.com/journal/11030/editors), and editor of Docking Screens for Drug Discovery (Methods of Molecular Biology)-Springer Nature. He is a reviewer for over 60 high-impact journals, including Nature Communications and Briefings in Bioinformatics. His research interests are interdisciplinary, with three emphases: machine learning, complex systems, and computational systems biology. He developed the concept of Scoring Function Space (https://doi.org/10.2174/0929867324666170623092503) and created several software to explore this hypothesis (https://github.com/azevedolab). He has over 200 publications about protein structures, computer models of complex systems, and simulations of protein systems. These publications have over 8,400 citations in Scopus (h-index: 50, m-quotient > 1.7), +8,000 on the Web of Science (h-index: 49), and +10,000 citations on Google Scholar (h-index: 55). Dr. Azevedo is a professor at the Federal University of Alfenas. (Texto informado pelo autor)

http://lattes.cnpq.br/4183276948524704 (15/07/2025)

Rótulo/Grupo:

Bolsa CNPq: Nível 1D

Período de análise:

Endereço: Universidade Federal de Alfenas. Rua Gabriel Monteiro da Silva - de 640/641 a 1098/1099 Centro 37130001 - Alfenas, MG - Brasil Telefone: (35) 37019000 URL da Homepage: https://github.com/azevedolab

Grande área: Ciências Biológicas

Área: Bioquímica

Citações: Google Acadêmico

Produção bibliográfica

Artigos completos publicados em periódicos (204)
1. ILDIZ, GULCE OGRUC ; DE AZEVEDO, WALTER F. ; FAUSTO, RUI. Preface -Molecular Structure and Mechanisms of Action of Antioxidants-. JOURNAL OF MOLECULAR STRUCTURE. v. 1319, p. 139641-139641, issn: 0022-2860, 2025. Qualis: A3
2. TARASOVA, OLGA ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Cyclin Dependent Kinases in Antiviral Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 32, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2025. Qualis: A1
3. SANTOS, LEANDRO MARCOS ; ARAÚJO, LEONARDO PEREIRA DE ; FALLEIROS, LORENA ; MARIANO, CAIO PACÍFICO ; JUNIOR, WALTER FILGUEIRA DE AZEVEDO ; SILVEIRA, Nelson José Freitas da. Medicinal Chemistry behind Capivasertib Discovery: Seventh Magic Bullet of the Fragment-based Drug Design Approved for Oncology. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 32, p. 1-26, issn: 0929-8673, 2025. Qualis: A1
4. BAUD, STEPHANIE ; FILGUEIRA DE AZEVEDO JR., WALTER. Protein-Ligand Docking Simulations for Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 32, p. 1-3, issn: 0929-8673, 2025. Qualis: A1
5. TUTONE, MARCO ; FILGUEIRA DE AZEVEDO JR., WALTER. Thirty Years of Structural Studies on Cyclin-Dependent Kinases: Implications for Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 32, p. 1-3, issn: 0929-8673, 2025. Qualis: A1
6. de Azevedo, Walter Filgueira; QUIROGA, RODRIGO ; VILLARREAL, MARCOS ARIEL ; DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS ; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA ; DA SILVA, AMAURI DUARTE ; VEIT'ACOSTA, MARTINA ; OLIVEIRA, PATRICIA RUFINO ; TUTONE, MARCO ; BIZIUKOVA, NADEZHDA ; POROIKOV, VLADIMIR ; TARASOVA, OLGA ; BAUD, STÉPHAINE. 2.0: Development of machine-learning models to explore the scoring function space. JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. v. 45, p. 1-14, issn: 0192-8651, 2024. Qualis: A1
7. FILGUEIRA DE AZEVEDO, WALTER. Machine Learning Meets Physics-based Modeling: A Mass-spring System to Predict Protein-ligand Binding Affinity. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 31, p. 1-16, issn: 0929-8673, 2024. Qualis: A1
8. FILGUEIRA DE AZEVEDO, JR., WALTER. Predicting Inhibition of CDK2 with SAnDReS: The Application of Machine Learning to Navigate the Scoring Function Space. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 31, p. 1-16, issn: 0929-8673, 2024. Qualis: A1
9. VÁZQUEZ-RODRÍGUEZ, SERGIO ; RAMÍREZ-CONTRERAS, DIEGO ; NORIEGA, LISSET ; GARCÍA-GARCÍA, AMALIA ; SÁNCHEZ-GAYTÁN, BRENDA L. ; MELÉNDEZ, FRANCISCO J. ; FILGUEIRA DE AZEVEDO, WALTER ; CASTRO, MARÍA EUGENIA ; GONZÁLEZ-VERGARA, ENRIQUE. Comparative Study of Docking Tools for Evaluation of Potential Copper Metallodrugs and Their Interaction with TMPRSS2. Inorganics. v. 12, p. 282, issn: 2304-6740, 2024. Qualis: Não identificado (INORGANICS)
10. SOUZA, DEBORA ; S, BRENO ; JR, WALTER ; S, NELSON. Study of non-silent and deletion mutations of SARS-CoV-2 in relation to viral behavior in the infectious process. International Journal of Molecular Biology Open Access. v. 7, p. 122-131, issn: 2573-2889, 2024. Qualis: Não identificado (INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY OPEN ACCESS)
11. VAZQUEZ-RODRIGUEZ, SERGIO ; RAMÍREZ-CONTRERAS, DIEGO ; NORIEGA, LISSET ; GARCÍA-GARCÍA, AMALIA ; SÁNCHEZ-GAYTÁN, BRENDA L. ; MELENDEZ, FRANCISCO J. ; CASTRO, MARÍA EUGENIA ; de Azevedo, Walter Filgueira ; GONZÁLEZ-VERGARA, ENRIQUE. Interaction of copper potential metallodrugs with TMPRSS2: A comparative study of docking tools and its implications on COVID-19. Frontiers in Chemistry. v. 11, p. 1-13, issn: 2296-2646, 2023. Qualis: A3
12. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; VILLARREAL, MARCOS A. ; QUIROGA, RODRIGO ; BIZIUKOVA, NADEZHDA ; POROIKOV, VLADIMIR ; TARASOVA, OLGA ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Exploring Scoring Function Space: Developing Computational Models for Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 30, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2023. Qualis: A1
13. AZEVEDO, WALTER. Machine learning for drug science. Machine learning for drug science.. Exploration of Drug Science. v. 1, p. 77-80, issn: 2836-7677, 2023. Qualis: Não identificado (EXPLORATION OF DRUG SCIENCE)
14. Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. The Impact of CrystallographicData for the Development of Machine Learning Models to Predict Protein-Ligand Binding Affinity. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-15, issn: 0929-8673, 2021. Qualis: A1
15. de Azevedo Junior, Walter Filgueira; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; GODOY, JOANA RETZKE ; ADRIANO, HILDA MAYELA ARAN ; DOS SANTOS BEZERRA, WALLYSON ANDRÉ ; DOS SANTOS SOARES, ALEXANDRA MARTINS. Protein-ligand Docking Simulations with AutoDock4 Focused on the Main Protease of SARS-CoV-2. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-15, issn: 0929-8673, 2021. Qualis: A1
16. PEPINO, REBEKA DE OLIVEIR ; COELHO, FERNANDA ; JANKU, TATIANE APARECIDA BUZANELLO ; ALENCAR, DIANDRA PINHEIRO ; DE AZEVEDO JR, WALTER FIGUEIRA ; CANDURI, Fernanda. Overview of PCTK3/CDK18: A Cyclin-Dependent Kinase Involved in Specific Functions in Post-Mitotic Cells. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2021. Qualis: A1
17. DA SILVEIRA, NELSON JOSÉ FREITAS ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira ; GUEDES, RITA CARDOSO ; SANTOS, LEANDRO MARCOS ; MARCELINO, RODOLFO CABRAL ; ANTUNES, PATRÍCIA ; ELIAS, THIAGO CABRAL. Bioinformatics approach on bioisosterism softwares to be used in drug discovery and development. Current Bioinformatics. v. 16, p. 1-15, issn: 1574-8936, 2021. Qualis: Não identificado (CURRENT BIOINFORMATICS)
18. Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Computational Prediction of Binding Affinity for CDK2-ligand Complexes. A Protein Target for Cancer Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2021. Qualis: A1
19. de Azevedo, Walter Filgueira. Application of Machine Learning Techniques for Drug Discovery. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 7805-7807, issn: 0929-8673, 2021. Qualis: A1
20. de Azevedo Jr., Walter Filgueira. Protein-ligand interactions. High-resolution structures of CDK2. Protein-ligand interactions. High-resolution structures of CDK2.. CURRENT DRUG TARGETS. v. 22, p. 438-440, issn: 1389-4501, 2021. Qualis: Não identificado (CURRENT DRUG TARGETS)
21. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Electrostatic Potential Energy in Protein-Drug Complexes. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 28, p. 1-17, issn: 0929-8673, 2021. Qualis: A1
22. de Azevedo, Walter Filgueira. Meet Our Section Editor. COMBINATORIAL CHEMISTRY & HIGH THROUGHPUT SCREENING. v. 23, p. 1-1, issn: 1386-2073, 2020. Qualis: Não identificado (COMBINATORIAL CHEMISTRY & HIGH THROUGHPUT SCREENING)
23. de Azevedo, Walter Filgueira. Meet Our Editorial Board Member. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 27, p. 4753-4753, issn: 0929-8673, 2020. Qualis: A1
24. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; RIZZOTTO, CAMILA ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira. Machine Learning-Based Scoring Functions. Development and Applications with SAnDReS.. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 27, p. 1746-1756, issn: 0929-8673, 2020. Qualis: A1
25. DA SILVA, AMAURI DUARTE ; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Taba: A Tool to Analyze the Binding Affinity. JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY. v. 41, p. jcc.26048, issn: 0192-8651, 2019. Qualis: A1
26. RUSSO, SILVANA ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira. Computational Analysis of Dipyrone Metabolite 4-Aminoantipyrine as a Cannabinoid Receptor 1 Agonist. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 26, p. 1-10, issn: 0929-8673, 2019. Qualis: A1
27. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; DA SILVA, AMAURI DUARTE ; de Azevedo Jr., Walter Filgueira. Application of Machine Learning Techniques to Predict Binding Affinity for Drug Targets. A Study of Cyclin-Dependent Kinase 2. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 26, p. 1-11, issn: 0929-8673, 2019. Qualis: A1
28. AMARAL, MARIA EDUARDA AZAMBUJA ; NERY, LAURA ROESLER ; LEITE, CARLOS EDUARDO ; de Azevedo Junior, Walter Filgueira ; CAMPOS, MARIA MARTHA. Pre-clinical effects of metformin and aspirin on the cell lines of different breast cancer subtypes. INVESTIGATIONAL NEW DRUGS. v. 36, p. 1-15, issn: 0167-6997, 2018. Qualis: A2
29. LEVIN, NAYARA MARIA BERNHARDT ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; DE MATTOS, BRUNA BOLDRINI ; DE CASTRO SILVÉRIO, ARIADNE ; de Azevedo, Walter Filgueira. Development of CDK-targeted scoring functions for prediction of binding affinity. BIOPHYSICAL CHEMISTRY. v. 235, p. 1-8, issn: 0301-4622, 2018. Qualis: A3
30. DE ÁVILA, MAURÍCIO BOFF ; de Azevedo, Walter Filgueira. Development of machine learning models to predict inhibition of 3-dehydroquinate dehydratase. Chemical Biology & Drug Design. v. 91, p. 1-8, issn: 1747-0277, 2018. Qualis: A4
31. FREITAS, POLIANY G. ; ELIAS, THIAGO C. ; PINTO, ICARO A. ; COSTA, LUCIANO T. ; DE CARVALHO, PAULO V.S.D. ; DE Q. OMOTE, DANIEL ; CAMPS, IHOSVANY ; ISHIKAWA, TATI ; ARCURI, HELEN A. ; VINGA, SUSANA ; OLIVEIRA, ARLINDO L. ; JUNIOR, WALTER F.A. ; DA SILVEIRA, NELSON J.F.. Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein. Letters in Drug Design & Discovery. v. 15, p. 488-499, issn: 1570-1808, 2018. Qualis: B1
32. DE ÁVILA, MAURÍCIO BOFF ; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; AZEVEDO, WALTER. Structural Basis for Inhibition of Enoyl-[Acyl Carrier Protein] Reductase (InhA) from Mycobacterium tuberculosis. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 26, p. 1-13, issn: 0929-8673, 2018. Qualis: A1
33. RUSSO, SILVANA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Advances in the Understanding of the Cannabinoid Receptor 1 - Focusing on the Inverse Agonists Interactions. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 25, p. 1908-1919, issn: 0929-8673, 2018. Qualis: A1
34. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Development of a machine-learning model to predict Gibbs free energy of binding for protein-ligand complexes. BIOPHYSICAL CHEMISTRY. v. 240, p. 63-69, issn: 0301-4622, 2018. Qualis: A3
35. VOLKART, PRISCYLLA ANDRADE ; BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; SOUTO, ANDRE ARIGONY ; de Azevedo, Walter Filgueira. Cyclin-Dependent Kinase 2 in Cellular Senescence and Cancer. A Structural and Functional Review.. CURRENT DRUG TARGETS. v. 20, p. 716-726, issn: 1389-4501, 2018. Qualis: Não identificado (CURRENT DRUG TARGETS)
36. LEVIN, N. M. B. ; Pintro VO ; Ávila MB ; de Mattos BB ; DE AZEVEDO, WALTER F.. Understanding the Structural Basis for Inhibition of Cyclin-Dependent Kinases. New Pieces in the Molecular Puzzle. CURRENT DRUG TARGETS. v. 18, p. 1104-1111, issn: 1389-4501, 2017. Qualis: Não identificado (CURRENT DRUG TARGETS)
37. HECK, GABRIELA SEHNEM ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; PEREIRA, RICHARD RENE ; DE ÁVILA, MAURICIO BOFF ; LEVIN, NAYARA MARIA BERNHARDT ; DE AZEVEDO, WALTER FILGUEIRA. Supervised Machine Learning Methods Applied to Predict Ligand- Binding Affinity. CURRENT MEDICINAL CHEMISTRY. v. 24, p. 2459-2470, issn: 0929-8673, 2017. Qualis: A1
38. FILGUEIRA DE AZEVEDO, WALTER. Meet Our Editorial Board Member. Current Bioinformatics. v. 12, p. 385-386, issn: 1574-8936, 2017. Qualis: Não identificado (CURRENT BIOINFORMATICS)
39. DE ÁVILA, MAURÍCIO BOFF ; XAVIER, MARIANA MORRONE ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Supervised machine learning techniques to predict binding affinity. A study for cyclin-dependent kinase 2. BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS. v. 494, p. 305-310, issn: 0006-291X, 2017. Qualis: A2
40. PINTRO, VAL OLIVEIRA ; AZEVEDO, WALTER F.. Optimized Virtual Screening Workflow. Towards Target-Based Polynomial Scoring Functions for HIV-1 Protease. COMBINATORIAL CHEMISTRY & HIGH THROUGHPUT SCREENING. v. 20, p. 1-7, issn: 1386-2073, 2017. Qualis: Não identificado (COMBINATORIAL CHEMISTRY & HIGH THROUGHPUT SCREENING)
41. FREITAS, P. G. ; ELIAS, T. C. ; PINTO, I. A. ; COSTA, L. T. ; CARVALHO, P. V. S. D. ; Omote, D ; CAMPS, I. ; ISHIKAWA, T. ; ARCURI, Helen Andrade ; VINGA, S. ; OLIVEIRA, A. L. ; de azevedo wf ; da Silveira, NJF. Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein.. Letters in Drug Design & Discovery. v. 14, p. 1-12, issn: 1570-1808, 2017.Qualis: B1
42. de Azevedo Junior, Walter F. Meet Our Editorial Board Member. Current Bioinformatics (Print). v. 11, p. 393-393, issn: 1574-8936, 2016. Qualis: Não identificado (CURRENT BIOINFORMATICS)
43. XAVIER, MARIANA ; HECK, GABRIELA ; DE AVILA, MAURÍCIO ; LEVIN, NAYARA ; PINTRO, VAL ; CARVALHO, NATHÁLIA ; AZEVEDO JR., WALTER. SAnDReS a Computational Tool for Statistical Analysis of Docking Results and Development of Scoring Functions. Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening. v. 19, p. 1-1, issn: 1386-2073, 2016. Qualis: Não identificado (COMBINATORIAL CHEMISTRY & HIGH THROUGHPUT SCREENING)
44. TELES, CAROLINA BIONI GARCIA ; MOREIRA-DILL, LEANDRO SOARES ; SILVA, ALEXANDRE DE ALMEIDA ; FACUNDO, VALDIR ALVES ; DE AZEVEDO, WALTER F. ; DA SILVA, LUIZ HILDEBRANDO PEREIRA ; MOTTA, MARIA CRISTINA M. ; STÁBELI, RODRIGO GUERINO ; SILVA-JARDIM, IZALTINA. A lupane-triterpene isolated from Combretum leprosum Mart. fruit extracts that interferes with the intracellular development of Leishmania (L.) amazonensis in vitro. BMC Complementary and Alternative Medicine (Online). v. 15, p. 165-174, issn: 1472-6882, 2015. Qualis: A1
45. DE AZEVEDO, WALTER. Opinion Paper: Targeting Multiple Cyclin-Dependent Kinases (CDKs): A New Strategy for Molecular Docking Studies. Current Drug Targets (Print). v. 17, p. 2-2, issn: 1389-4501, 2015. Qualis: Não identificado (CURRENT DRUG TARGETS)
46. CORACINI, J. D. ; DE AZEVEDO WF. Shikimate Kinase, a Protein Target for Drug Design. Current Medicinal Chemistry. v. 21, p. 592-604, issn: 0929-8673, 2014. Qualis: A1
47. AVILA, MAURICIO ; JR., WALTER. Data Mining of Docking Results. Application to 3-Dehydroquinate Dehydratase. Current Bioinformatics (Print). v. 9, p. 361-379, issn: 1574-8936, 2014. Qualis: Não identificado (CURRENT BIOINFORMATICS)
48. Caceres, Rafael A. ; Timmers, Luís F.S.M. ; Ducati, Rodrigo G. ; da Silva, Diego O.N. ; Basso, Luiz Augusto ; DE AZEVEDO WF ; Santos, Diógenes S.. Crystal structure and molecular dynamics studies of purine nucleoside phosphorylase from Mycobacterium tuberculosis associated with acyclovir. Biochimie (Paris. Print). v. 94, p. 155-165, issn: 0300-9084, 2012. Qualis: A2
49. Timmers, Luís Fernando Saraiva Macedo ; Ducati, Rodrigo Gay ; Sánchez-Quitian, Zilpa Adriana ; Basso, Luiz Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; Azevedo, Walter Filgueira. Combining molecular dynamics and docking simulations of the cytidine deaminase from Mycobacterium tuberculosis H37Rv. Journal of Molecular Modeling. v. 18, p. 467-479, issn: 1610-2940, 2012. Qualis: A4
50. Vianna, Carolina Pasa ; Azevedo, Walter Filgueira. Identification of new potential Mycobacterium tuberculosis shikimate kinase inhibitors through molecular docking simulations. Journal of Molecular Modeling (Online). v. 18, p. 755-764, issn: 0948-5023, 2012. Qualis: A4
51. Soares, Milena B.P. ; Silva, Cinara V. ; Bastos, Tanira M. ; Guimarães, Elisalva T. ; Figueira, Claudio P. ; Smirlis, Despina ; DE AZEVEDO WF. Anti-Trypanosoma cruzi activity of nicotinamide. Acta Tropica. v. 122, p. 224-229, issn: 0001-706X, 2012. Qualis: A2
52. MORAES, FERNANDA PRETTO ; Azevedo, Walter Filgueira. Targeting imidazoline site on monoamine oxidase B through molecular docking simulations. Journal of Molecular Modeling (Online). v. 18, p. 3877-3886, issn: 0948-5023, 2012. Qualis: A4
53. ROSADO, LEONARDO A ; CACERES, RAFAEL ; DE AZEVEDO, WALTER ; BASSO, LUIZ A ; SANTOS, DIÓGENES S. Role of Serine140 in the mode of action of Mycobacterium tuberculosis β-ketoacyl-ACP Reductase (MabA). BMC Research Notes. v. 5, p. 526, issn: 1756-0500, 2012. Qualis: Não identificado (BMC RESEARCH NOTES)
54. AZEVEDO, L. S. ; MORAES, FERNANDA PRETTO ; Xavier MM ; PANTOJA, E. O. ; VILLAVICENCIO, B. ; FINCK, J. A. ; PROENCA, A. M. ; ROCHA, K. B. ; de Azevedo Junior, Walter F.. Recent Progress of Molecular Docking Simulations Applied to Development of Drugs. Current Bioinformatics (Print). v. 7, p. 352-365, issn: 1574-8936, 2012. Qualis: Não identificado (CURRENT BIOINFORMATICS)
55. Heberle, G. ; DE AZEVEDO WF. Bio-Inspired Algorithms Applied to Molecular Docking Simulations. Current Medicinal Chemistry. v. 18, p. 1339-1352, issn: 0929-8673, 2011. Qualis: A1
56. DE AZEVEDO WF. Editorial [Hot Topic:Protein targets for development of drugs against Mycobacterium tuberculosis (Guest Editor: Walter Filgueira de Azevedo)]. Current Medicinal Chemistry. v. 18, p. 1255-1257, issn: 0929-8673, 2011. Qualis: A1
57. DE AZEVEDO WF. Molecular Dynamics Simulations of Protein Targets Identified in Mycobacterium tuberculosis. Current Medicinal Chemistry. v. 18, p. 1353-1366, issn: 0929-8673, 2011. Qualis: A1
58. Rocha, Bruno A.M. ; DELATORRE, Plinio ; Oliveira, Taianá M. ; Benevides, Raquel G. ; Pires, Alana F. ; Sousa, Albertina A.S. ; Souza, Luis A.G. ; Assreuy, Ana Maria S. ; Debray, Henri ; Sampaio, Alexandre H. ; CAVADA, Benildo S. ; DE AZEVEDO WF. Structural basis for both pro- and anti-inflammatory response induced by mannose-specific legume lectin from Cymbosema roseum. Biochimie (Paris. Print). v. 93, p. 806-816, issn: 0300-9084, 2011. Qualis: A2
59. Sánchez-Quitian, Zilpa A. ; Timmers, Luís F.S.M. ; Caceres, Rafael A. ; Rehm, Jacqueline G. ; Thompson, Claudia E. ; Basso, Luiz A. ; Santos, Diógenes S. ; DE AZEVEDO WF. Crystal structure determination and dynamic studies of Mycobacterium tuberculosis Cytidine deaminase in complex with products. Archives of Biochemistry and Biophysics (Print). v. 509, p. 108-115, issn: 0003-9861, 2011. Qualis: A2
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174. CAMERA JUNIOR, Joao Carlos ; de azevedo wf. Construa um cluster Beowulf para reinderização de Imagens (Parte III). PC&Cia. v. 15, p. 18-21, issn: 1519-6267, 2002.Qualis: Não identificado (PC&CIA)
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184. FADEL, Valmir ; Honda R ; DELLAMANO, M. ; SMARRA, A. L. S. ; DELATORRE, Plinio ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O. ; de azevedo wf. Purification, crystallization, and preliminary X-ray diffraction analysis of carbomonoxy hemoglobin-II from the fish "Piaractus mesopotamicus" (Pacu). Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. v. 56, p. 366-367, issn: 0907-4449, 2000. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY)
185. SMARRA, A. L. S. ; de azevedo wf ; FADEL, Valmir ; DELATORRE, Plinio ; DELLAMANO, M. ; COLOMBO, M. F. ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Purification, crystallization, and preliminary X-ray analysis of hemoglobin-I from the armored catfish "Liposarcus anisitsi". Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. v. D56, p. 495-497, issn: 0907-4449, 2000. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY)
186. CANDURI, F. ; DELATORRE, Plinio ; FADEL, Valmir ; LORENZI, C. C. B. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; RUGGIERO NETO, João ; KONNO, K. ; PALMA, Mário Sérgio ; YAMANE, Tetsuo ; de azevedo wf. Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a eumenine mastoparan toxin: a new class of mast-cell degranulating peptide in the wasp venom. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. v. 56, p. 1434-1436, issn: 0907-4449, 2000. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY)
187. Honda R ; DELATORRE, Plinio ; FADEL, Valmir ; CANDURI, F. ; DELLAMANO, M. ; de azevedo wf ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Crystallization, preliminary X-ray analysis and molecular-replacement solution of the carboxy form of haemoglobin I from the fish Brycon cephalus. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. v. 56, n. 12, p. 1685-1687, issn: 0907-4449, 2000. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY)
188. DELATORRE, Plinio ; DELLAMANO, M. ; FADEL, Valmir ; Honda R ; SMARRA, A. L. S. ; CANDURI, F. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O. ; de azevedo wf. Crystallographic studies of fish hemoglobins. Eclética Química (Araraquara). v. 25, p. 147-159, issn: 0100-4670, 2000.Qualis: B3
189. SEIXAS, F. A. V. ; de azevedo wf ; COLOMBO, M. F.. Crystallization and X-Ray diffraction data analysis of human deoxy-hemoglobin A0 stripped of any anions. Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. v. 55, p. 1914-1916, issn: 0907-4449, 1999. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY)
190. SMARRA, A. L. S. ; FADEL, Valmir ; DELLAMANO, M. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; de azevedo wf ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Crystallization, preliminary X-ray diffraction analysis, and Patterson search of Oxyhemoglobin-I of the wolf ("Chrysocyon brachiurus"). Acta Crystallographica. Section D, Biological Crystallography. v. 55, p. 1618-1619, issn: 0907-4449, 1999. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION D, BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY)
191. de azevedo wf; WARD, R. J. ; GUTIÉRREZ, J. M. ; ARNI, R. K.. Structure of a Lys49-Phospholipase A2 homologue isolated from the venom of "Bothrops nummifer" (jumping viper). Toxicon. v. 37, p. 371-384, issn: 0041-0101, 1999. Qualis: A4
192. de azevedo wf; GIOTTO, M. T. S. ; GARRATT, R. ; OLIVA, G. ; MASCARENHAS, Y. P. ; AZEVEDO JR, W. F. ; GIGLIO, J. R. ; CINTRA, A. C. O. ; ARNI, R. K. ; WARD, R.. Crystallographic and spectroscopy characterization of a molecular hinge: conformation change In bothropstoxin I, a dimeric K49-phospholipase homologue. Proteins. v. 30, n. 30, p. 442-454, issn: 0887-3585, 1998. Qualis: A3
193. de azevedo wf; CANDURI, F. ; TEODORO, L. G. V. L. ; LORENZI, C. C. B. ; GOMES, R. A. S. ; FONTES, M. R. M. ; ARNI, R. K. ; AZEVEDO JR, W. F.. Crystallization, preliminary X-Ray analysis, and Patterson search of a new aspartic protease Isolated from human urine. Biochemistry and Molecular Biology International. v. 46, p. 355-363, issn: 1039-9712, 1998.Qualis: Não identificado (BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY INTERNATIONAL)
194. de azevedo wf; WARD, R. J. ; CANDURI, F. ; SOARES, A. ; GIGLIO, J. R. ; ARNI, R. K.. Crystal structure of piratoxin-I: a calcium-independent, myotoxic phospholipase A2-homologue from "Bothrops pirajai" venom. Toxicon. v. 36, p. 1395-1406, issn: 0041-0101, 1998. Qualis: A4
195. WARD, R. J. ; de azevedo wf ; ARNI, R. K.. At Interface: Crystal structures of phospholipases A2. Toxicon. v. 36, p. 1623-1633, issn: 0041-0101, 1998. Qualis: A4
196. LOMBARDI, F. R. ; FONTES, M. R. M. ; SOUZA, G. M. O. ; COELHO, L. C. B. B. ; ARNI, R. K. ; de azevedo wf. Crystallization and preliminary X-ray analysis of "Parkia pendula" lectin. Protein and Peptide Letters. v. 5, p. 117-120, issn: 0929-8665, 1998.Qualis: Não identificado (PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS)
197. de azevedo wf; WARD, R. J. ; GUTIÉRREZ, J. M. ; DIAZ, C. ; ARNI, R. K.. Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a Lys49-PLA2 homologue from "Cerrophidion godmani" venom. Protein and Peptide Letters. v. 5, p. 121-126, issn: 0929-8665, 1998.Qualis: Não identificado (PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS)
198. de azevedo wf; FONTES, M. R. M. ; WARD, R. J. ; LOMBARDI, F. R. ; CINTRA, A. C. O. ; GIGLIO, J. R. ; ARNI, R. K.. Crystallization of SIII-SPIII, a phospholipase A2 isolated from the venom of "Bothrops jararacussu". Protein and Peptide Letters. v. 5, p. 181-184, issn: 0929-8665, 1998.Qualis: Não identificado (PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS)
199. CANDURI, F. ; WARD, R. J. ; de azevedo wf ; GOMES, R. A. S. ; ARNI, R. K.. Purification and partial characterization of Cathepsin D from Porcine ("Sus scrofa") liver using affinity chromatography. Biochemistry and Molecular Biology International. v. 45, p. 797-803, issn: 1039-9712, 1998.Qualis: Não identificado (BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY INTERNATIONAL)
200. de azevedo wf; LECLERC, S. J. ; MEIJER, L. ; HAVLICEK, L. ; STRNAD, M. ; KIM, S. H.. Inhibition of cyclin-dependent kinases by purine analogues: crystal structure of human cdk2 complexed with roscovitine. European Journal of Biochemistry. v. 243, n. 243, p. 518-526, issn: 0014-2956, 1997. Qualis: C (EUROPEAN JOURNAL OF CHEMISTRY)
201. de azevedo wf; AZEVEDO JR, W. F. ; WARD, R. J. ; LOMBARDI, F. R. ; GIGLIO, J. R. ; FONTES, M. R. M. ; ARNI, R. K.. Crystal structure of myotoxin-II: a myotoxic phospholipase A2- homologue from "Bothrops moojeni" venom. Protein and Peptide Letters. v. 4, n. 5, p. 329-334, issn: 0929-8665, 1997.Qualis: Não identificado (PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS)
202. de azevedo wf; SMARRA, A. L. S. ; ARNI, R. K. ; AZEVEDO JR, W. F. ; COLOMBO, M. F. ; BONILLA-RODRIGUES, G. O.. Crystallization and X-Ray diffraction data analysis of oxyhemoglobin-I from the catfish "Liposarcus anisitsi" (PISCES). Protein and Peptide Letters. v. 4, n. 5, p. 349-354, issn: 0929-8665, 1997.Qualis: Não identificado (PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS)
203. de azevedo wf; H-, J. J. M. ; SCHULZE-GAHMEN, U. ; WORLAND, P. J. ; SAUSVILLE, E. ; KIM, S. H.. Structural basis for specificity and potency of a flavonoid inhibitor of human CDK2, a cell cycle kinase. PNAS. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. v. 93, p. 2735-2740, issn: 0027-8424, 1996.Qualis: A1
204. de azevedo wf; MASCARENHAS, Y. P. ; SOUSA, G. F. ; FILGUEIRAS, C. A. L.. Cis-[1,2-Bis (Propylsulfinyl) Ethane-S,S']- Dichloroplatinum(II). Acta Crystallographica. Section C, Crystal Structure Communications. v. 51, n. 51, p. 619-621, issn: 0108-2701, 1995. Qualis: Não identificado (ACTA CRYSTALLOGRAPHICA. SECTION C, CRYSTAL STRUCTURE COMMUNICATIONS)
Livros publicados/organizados ou edições (2)
1. AZEVEDO, WALTER. Docking Screens for Drug Discovery (Softcover). 1 ed. New York, NY: Humana Press, 2020. v. 2053, p. 286.
2. de Azevedo, Walter Filgueira. Methods in Molecular Biology. 1 ed. New York: Springer New York, 2019. v. 2053, p. 286.
Capítulos de livros publicados (16)
1. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. How Docking Programs Work. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 35-50.
2. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. SAnDReS: A Computational Tool for Docking. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 51-65.
3. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo, Walter Filgueira. Electrostatic Energy in Protein¿Ligand Complexes. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 67-77.
4. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo, Walter Filgueira. Van der Waals Potential in Protein Complexes. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.p. 79-91.
5. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; Veit-Acosta, Martina ; de Azevedo, Walter Filgueira. Hydrogen Bonds in Protein-Ligand Complexes. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 93-107.
6. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Molecular Dynamics Simulations with NAMD2. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 109-124.
7. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; PINTRO, VAL OLIVEIRA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Docking with AutoDock4. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 125-148.
8. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Molegro Virtual Docker for Docking. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 149-167.
9. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Docking with GemDock. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 169-188.
10. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Docking with SwissDock. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 189-202.
11. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Molecular Docking Simulations with ArgusLab. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 203-220.
12. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Homology Modeling of Protein Targets with MODELLER. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 231-249.
13. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Machine Learning to Predict Binding Affinity. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 251-273.
14. BITENCOURT-FERREIRA, GABRIELA ; de Azevedo, Walter Filgueira. Exploring the Scoring Function Space. Em: Walter Filgueira de Azevedo Junior. (Org.). Methods in Molecular Biology. 1ed.New York. : Springer New York. 2019.v. 2053, p. 275-281.
15. LOMBARDI, F. R. ; ANAZETTI, M. C. ; SANTOS, Giovani Cesar dos ; POLIZELLI, P. P. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; de Azevedo, Walter Filgueira ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Oxygen Binding Properties and Tetrameric Stability of Hemoglobins From the Snakes Crotalus Durissus Terrificus and Liophis Miliaris. Em: Ben M. Dunn. (Org.). Oxygen Binding Properties and Tetrameric Stability of Hemoglobins From the Snakes Crotalus Durissus Terrificus and Liophis Miliaris. 1ed. : Bentham. 2014.v. 1, p. 3-30.
16. KIM, S. H. ; SCHULZE-GAHMEN, U. ; BRANDSEN, J. ; de azevedo wf. Strutural Basis For Chemical Inhibition Of Cdk2. Em: L. Meijer, S. Guidet, L. Vogel. (Org.). PROGRESS IN CELL CYCLE RESEARCH. 1ed.New York, USA. : Plenum Press. 1996.v. 02, p. 137-145.
Textos em jornais de notícias/revistas (2)
1. FADEL, Valmir ; de azevedo wf. Aluno do ibilce pesquisa com prêmio Nobel. Diário da Região (São José do Rio Preto/SP), 20 out. 2002.
2. de azevedo wf; OLIVIERI, Johnny Rizzieri. O Ibilce e a pesquisa. diário da região (S. J. do Rio Preto), São José do Rio Preto/SP, p. 3A-3A, 11 out. 2000.
Trabalhos completos publicados em anais de congressos (0)
Resumos expandidos publicados em anais de congressos (0)
Resumos publicados em anais de congressos (91)
1. VIVAN, A. L. ; DE AZEVEDO, WF. ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystallization of Prephenate Dehydratase from Mycobacterium tuberculosis. Em: XXXVI Annual Meeting of the SBBq and 10th IUBMB Conference., 2007, Salvador/BA. Abstracts of XXXVI Annual Meetinof the SBBq. São Paulo/SP: SBBq, v. 2007, p. N-80-N-80, 2007.
2. Silva, A. V. R ; MARQUES, M. R. ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; DE AZEVEDO, WF. ; PALMA, Mário Sérgio. Pep-induced conformational changes in EPSP-Synthase from Mycobacterium tuberculosis determined by hydrogen-deuterium exchange and mass spectrometry. Em: XXXVI Annual Meeting of the SBBq and 10th IUBMB Conference., 2007, Salvador/BA. Abstracts of XXXVI Annual Meetinof the SBBq, 2007. São Paulo/SP: SBBq, v. 2007, p. N-2-N-2, 2007.
3. SANTOS, B. B. ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; ELY, F. ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, D S ; de azevedo wf. Crystallization and preliminary X-ray crystallographic studies of chorismate synthase from "Mycobacterium tuberculosis" in native form and complexed with ligands. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 89-89, 2006.
4. DOMINGUES, M. N. ; ARCURI, Helen Andrade ; GAVA, L. M. ; RAMOS, C. H. I. ; de azevedo wf ; RUGGIERO NETO, João ; BORGES, J. C.. Molecular modeling of human molecular chaperone HSP40 DJA1 as monomer and dimer. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóias. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 89-89, 2006.
5. SOUZA, M. M. ; CORTINÓZ, J. R. ; CANDURI, Fernanda ; MORENO, F. B. M. B. ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; OLIVEIRA, J S ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystallographic structure of purine nucleoside phosphorylase from "Mycobacterium tuberculosis" in complex with adenine. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Águas de Lindóia: SBBq, v. 1, p. 89-89, 2006.
6. CANDURI, F. ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; de azevedo wf. Molecular models of enzymes of the oxidative pentose phosphate pathway from "Mycobacterium tuberculosis". Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 91-91, 2006.
7. BORGES, J. C. ; PEREIRA, José Henrique ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; SANTOS, Giovani Cesar dos ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; RAMOS, C. H. I. ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Phosphate closes the solution structure of the 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase (EPSPS) from "Mycobacterium tuberculosis". Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulos: SBBq, v. 1, p. 91-91, 2006.
8. PEREZ, P. C. ; CANDURI, Fernanda ; de azevedo wf. Structural basis for inhibition of cdk3 by roscovitine. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulos: SBBq, v. 1, p. 91-91, 2006.
9. MARTIL, Daiane e ; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista ; CAVADA, Benildo S. ; de azevedo wf. Structural studies of a fucose binding lectin from "Lotus tetragonolobus" seeds. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 93-93, 2006.
10. GAVA, L. M. ; DOMINGUES, M. N. ; SILVA, R G ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Structural studies of human purine nucleoside phosphorylase in complex with ligands. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 93-93, 2006.
11. FAIM, L. M. ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; VASCONCELOS, I. B. ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, D S ; de azevedo wf. Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of the complexes: shikimate kinase:ADP:shikimate and shikimate kinase:adp:mg2+ from "Mycobacterium tuberculosis". Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulos: SBBq, v. 1, p. 93-93, 2006.
12. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; FAIM, L. M. ; OLIVEIRA, J S ; SANTOS, B. B. ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Effect of chlorate and magnesium ions and the shikimate in the structure of shikimate kinase from "Mycobacterium tuberculosis". Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 93-93, 2006.
13. MARQUES, M. R. ; MENDES, Maria Anita ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf ; RUGGIERO NETO, João ; PALMA, Mário Sérgio. Ligand-induced conformational changes in EPSPS from "Mycobacterium tuberculosis" determined by hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry and circular dichroism. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 93-93, 2006.
14. CORTINÓZ, J. R. ; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista ; SOUZA, M. M. ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystallographic structure of PNP from "Mycobacterium tuberculosis" complexed with 2,3 dideoxyinosine. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 98-98, 2006.
15. Lente ARS ; de azevedo wf ; CANDURI, F.. Comparative molecular modeling of cdk8 in complex with ligands. Em: XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2006, Águas de Lindóia. Resumos da XXXV reunião anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. São Paulo: SBBq, v. 1, p. 119-119, 2006.
16. GAVA, L. M. ; CANDURI, Fernanda ; SILVA, R G ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystal structure of human purine nucleoside phosphorylase complexed with quinazolinone. Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia/SP. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
17. RODRIGUES, N. C. ; PEREIRA, José Henrique ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Analysis of S94A Mutant Form of InhA from Mycobacterium tuberculosis complexed with IQG-607. Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia/SP. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
18. LEOPOLDINO, A. M. ; FEITOSA, O. A. ; CARREGARO, F. ; SELIG, A. ; TROVÓ, A B ; de azevedo wf ; TAJARA, Eloisa. Expression, characterization, homology modelling and molecular interaction field studies to the design of novel anti-cancer drugs of two target proteins in head and neck cancer. Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia/SP. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
19. MARQUES, M. R. ; MENDES, Maria Anita ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf ; PALMA, Mário Sérgio. Probing Folding/Unfolding Processes in the Enzyme 5-Enolpyruvylshikimate 3-Phosphate Synthase from Mycobacterium tuberculosis Monitoring the H/D exchange by ESI-MS. Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia/SP. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
20. LOMBARDI, F. R. ; PERES, Patricia ; de azevedo wf ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Tetramer stability and structural analysis of the modeled hemoglobin from "Liophis miliaris". Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
21. AGUIAR, M. B. ; RIBEIRO, S. P. ; PERTINHEZ, Thelma de Aguiar ; PALMA, Mário Sérgio ; de azevedo wf ; FADEL, Valmir. NMR Structure of peptide isolated from the venom of the social wasp. Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
22. SOUZA, B. M. ; MENDES, Maria Anita ; CABRERA, M. P. S. ; RUGGIERO NETO, João ; de azevedo wf ; PALMA, Mário Sérgio. Secundary structure of polycationic peptides from wasp venoms. Em: XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2005, Águas de Lindóia/SP. Resumos da XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, v. 1, p. 1-1, 2005.
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83. de azevedo wf; SMARRA, A. L. S. ; ARNI, R. K. ; AZEVEDO JR, W. F. ; COLOMBO, M. F. ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O.. Purification, Crystallization And X- Ray Diffraction Data Analysis Of Oxyhemoglobin-I From The Catfish-Liposarsus Anisitsi (Pisces). Em: VIII WORKSHOP ANUAL DE USUARIOS DO LNLS, v. 1, 1997.
84. de azevedo wf; AZEVEDO JR, W. F. ; WARD, R. J. ; LOMBARDI, F. R. ; SOARES, A. M. ; GIGLIO, J. R. ; FONTES, M. R. M. ; ARNI, R. K.. Crystal Structure Of Myotoxin-Ii: A Myotoxic Phospholipase A2-Homologue From Bothrops Moojeni Venom. Em: VIII Workshop Anual de Usuarios do LNLS, v. 01, 1997.
85. de azevedo wf; AZEVEDO JR, W. F. ; WARD, R. J. ; ARNI, R. K. ; GIGLIO, J. R.. "Crystal Structure Of Piratoxin I A Calcium-Independent Phospholipase-Like Myotoxic Protein From Bothrops Pirajai Venom". Em: VIII Workshop Anual de Usuários do LNLS, 1997.
86. de azevedo wf; LOMBARDI, F. R. ; FONTES, M. R. M. ; COELHO, L. C. B. B. ; ARNI, R. K. ; AZEVEDO JR, W. F.. "Cristalização e Análise Cristalografica Preliminar das Lectinas Parkia Platycephala e Isoforma de Parkia Pendula". Em: VIII Workshop Anual de Usuarios do LNLS, 1997.
87. de azevedo wf; GIOTTO, M. T. S. ; AZEVEDO, W. F. ; HORJALES, E. J. ; OLIVA, G. ; GARRATT, R. ; CINTRA, A. C. O. ; GIGLIO, R. ; ARAÚJO, H. S. S. ; MASCARENHAS, Y. P.. "Crystallization And Preliminary X-Ray Crystallographic Analysis Of A Lys49 Phospholypase A2 (Bthtx-I) Extracted From The Venom Of Bothops Jararacussu". Em: American Crystallographic Association Annual Meeting, v. 01, 1994.
88. de azevedo wf; MASCARENHAS, Y. P.. Estrutura Cristalina do Trans Dicloro[ (Trietilfosfina) (2-metilsulfinil) pirina] platina(II). Em: XV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1992, Caxambu-MG. ENFMC. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, v. XV, p. 78-78, 1992.
89. de azevedo wf; TROMBELLA, C. A. ; MASCARENHAS, Y. P. ; MACEDO, J. C. D.. Estudo da Porosidade do Caulim e do Metauclim. Em: XIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada, 1990, Caxambu-MG. ENFMC. São Paulo: Sociedade Brasileira de Física, v. XIII, p. 44-44, 1990.
90. BONILLA-RODRIGUEZ, G. O. ; LOMBARDI, F. R. ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; de azevedo wf ; ANAZETTI, M. C. ; SANTOS, Giovani Cesar dos. Snake hemoglobins tetramer stability analyzed by osmotic stress, gel filtration, SAXS and modeling. Febs Journal. v. 272, p. 362-363, 2005, 2005.
91. CABRERA, M. P. S. ; KONNO, K. ; PALMA, Mário Sérgio ; de azevedo wf ; RUGGIERO NETO, João. Conformarional analysis, lytic and biological activity of bioactive peptides. Biophysical Journal. v. 88, n.1, p. 251-251, 2005, 2005.
Artigos aceitos para publicação (0)
Apresentações de trabalho (4)
1. AZEVEDO, WALTER. Keynote lecture: Harnessing Machine Learning for Drug Discovery. 2022. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
2. DE AZEVEDO WF. Biologia de Sistemas Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Fármacos. Um Estudo de Inibidores da Protease do HIV-1. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
3. DE AZEVEDO WF. Biologia de Sistemas Computacional Aplicada ao Desenvolvimento de Fármacos: Um Estudo de Inibidores da Quinase Dependente de Ciclina (CDK). 2018. Apresentação de Trabalho/Conferência ou palestra
4. DEAZEVEDOJR, W. Astrobiologia. Estamos Sozinhos no Universo?. 2018. Apresentação de Trabalho/Seminário
Demais tipos de produção bibliográfica (1)
1. de azevedo wf. Biologia Molecular da Célula. Porto Alegre: artmed. 2004. Tradução/Livro

Produção técnica

Programas de computador com registro (0)
Programas de computador sem registro (6)
1. de Azevedo Jr., W.F.; DIAS, R. . ProtLigScore. 2009.
2. OLIVEIRA, N. A. ; de azevedo wf . Biolinux-BR. 2005.
3. de azevedo wf; COCONESI, A. A. C. . Bravo-Xplor. 2005.
4. de azevedo wf; SILVEIRA, Nelson J F. DBMODELING. 2005.
5. UCHOA, Hugo Brandão ; JORGE, G e ; SILVEIRA, Nelson J F ; CAMERA JUNIOR, Joao Carlos ; CANDURI, Fernanda ; de azevedo wf. Parmodel: a web server for automated comparative modeling of proteins. 2004.
6. de azevedo wf; DELATORRE, Plinio. Simulation of eletron density of crystal structures using Mathematica. 2001.
Produtos tecnológicos (0)
Processos ou técnicas (0)
Trabalhos técnicos (12)
1. de azevedo wf. Referee da revista Journal of Applied Crystallography (ISSN: 0021-8898)(Fator de impacto no ano base de 2004: 3.543). 2005.
2. de azevedo wf. Referee da revista Acta Crystallographica Section F. Structural Biology and Crystallization Communications (ISSN: 1744-3091). 2005.
3. de azevedo wf. Referee da revista Current Drug Targets (ISSN: 1389-4501)(Fator de impacto no ano base de 2004: 4.104). 2005.
4. de azevedo wf. Referee da revista Expert Opinion on Therapeutic Patents (ISSN:1354-3776) (Fator de impacto no ano base de 2004: 1.460). 2005.
5. de azevedo wf. Referee da revista BioTechniques(ISSN: 0736-6205)(Fator de impacto no ano base de 2004: 2,545). 2005.
6. de azevedo wf. Referee da revista Structure (ISSN: 0969-2126)(Fator de impacto no ano base de 2004: 5.185). 2004.
7. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. Tutorials for Docking Simulations. 2021; Tema: Tutorials for Docking Simulations. 2021.
8. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. SAnDReS. 2021; Tema: Statistical Analysis of Docking Results and Scoring functions. 2021.
9. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. SFSXplorer. 2021; Tema: Scoring Function Space Explorer. 2021.
10. BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA ; AZEVEDO, WALTER. Receptor-Ligand Systems Database. 2021; Tema: Receptor-Ligand Systems Database. 2021.
11. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. azevedolab.net. 2021; Tema: Computational systems biology, computational biology, bioinformatics. 2021.
12. AZEVEDO, WALTER; BITENCOURT'FERREIRA, GABRIELA. Tool to Analyze the Binding Affinity. 2021; Tema: Tool to Analyze the Binding Affinity. 2021.
Demais tipos de produção técnica (80)
1. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Python. 2a Edição. 2016. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
2. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Aprendizado de Máquina. Uma introdução com a linguagem Python. 1a Edição. 2016. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
3. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Perl. 3a Edição. 2013. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
4. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Perl. 4a Edição. 2013. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
5. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão em Bioinformática. 2013. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
6. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Perl. 2a Edição. 2012. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
7. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão Bioinformática. Uma introdução com a linguagem Python. 2012. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
8. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão em Bioinformática. 1a Edição. 2012. 0. Curso de curta duração ministrado/Extensão
9. AZEVEDO, WALTER. 3SCZ:. 2012. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
10. AZEVEDO, WALTER. 3IOM: Crystal structure of Purine Nucleoside Phosphorylase from Mycobacterium tuberculosis in complex with 2'-Deoxyguanosine. 2011. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
11. AZEVEDO, WALTER. 3IJF: Crystal structure of cytidine deaminase from Mycobacterium tuberculosis. 2010. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
12. AZEVEDO, WALTER. 3D1V: Crystal structure of human PNP complexed with 2-mercapto(3H) quinazolinone. 2009. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
13. AZEVEDO, WALTER. Curso de Extensão em Bioinformática Estrutural. 2007. Curso de curta duração ministrado/Extensão
14. CAVADA, Benildo S. ; DE AZEVEDO, WF.. cDNA cloning and 1.75A crystal structure determination of PPL2, a novel chimerolectin from Parkia platycephala seeds exhibiting endochitinolytic activity (Código PDB: 2GSJ). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
15. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BASSO, Luis Augusto ; DE AZEVEDO, WF. ; SANTOS, Diógenes Santiago. CRYSTAL STRUCTURE of ISONIAZID-RESISTANT S94A ENOYL-ACP(COA) REDUCTASE MUTANT ENZYME FROM MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS UNCOMPLEXED (Código PDB: 2IED). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
16. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; DE AZEVEDO, WF.. Crystal Structure of Isoniazid-resistant S94A ENOYL-ACP(COA) Reductase Mutant Enzyme from MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS in Complex with NADH-INH (Código PDB: 2IEB). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
17. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; DE AZEVEDO, WF.. Crystal Structure of Isoniazid-resistant I21V Enoyl-ACP(COA) Reductase Mutant Enzyme From MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS in Complex with NADH-INH (Código PDB: 2IE0). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
18. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BASSO, Luis Augusto ; DE AZEVEDO, WF. ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of wild type Enoyl-ACP(CoA) reductase from Mycobacterium tuberculosis in complex with NADH-INH (Código PDB: 2IDZ). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
19. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BASSO, Luis Augusto ; DE AZEVEDO, WF. ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of chorismate synthase from Mycobacterium tuberculosis at 2.22 angstrons of resolution (Código PDB: 2G85). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
20. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BASSO, Luis Augusto ; DE AZEVEDO, WF. ; SANTOS, Diógenes Santiago. Structure of shikimate kinase from Mycobacterium tuberculosis complexed with ADP and Mg at 2.8 angstrons of resolution (Código PDB: 2DFT). 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
21. AZEVEDO, WALTER; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista ; CAVADA, Benildo S.. 2P2K: Crystal structure of a lectin from Canavalia gladiata seeds (CGL) in complex with man1-4man-OMe. 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
22. AZEVEDO, WALTER; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista ; CAVADA, Benildo S.. 2OVU: Crystal structure of a lectin from Canavalia gladiata (CGL) in complex with man1-2man-OMe. 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
23. AZEVEDO, WALTER; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista ; CAVADA, Benildo S.. 2OW4: Crystal structure of a lectin from Canavalia maritima seeds (ConM) in complex with man1-2man-OMe. 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
24. AZEVEDO, WALTER; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista ; CAVADA, Benildo S.. 2EF6: Canavalia gladiata lectin complexed with Man1-3Man-OMe. 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
25. AZEVEDO, WALTER; DELATORRE, P. ; CAVADA, Benildo S. ; MORENO, Frederico Bruno Mendes Batista. 2ZBJ: Crystal structure of Dioclea rostrata lectin. 2007. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
26. de azevedo wf. Biofísica. Uma abordagem molecular. 2006. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de material didátido on-line
27. FADEL, Valmir ; BETTENDORF, P ; HERRMANN, T. ; de azevedo wf ; OLIVEIRA, Eduardo Brandt de ; YAMANE, Tetsuo ; WUTHRICH, K.. Solution structure of crotamine, a myotoxin from "Crotalus durissus terrificus" (Código PDB: 1Z99). 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
28. SILVA, R G ; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, Fernanda ; de azevedo wf ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of human PNP complexed with MESG (Código PDB: 1YRY). 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
29. GADELHA, C. A. A. ; MORENO, F. B. M. B. ; SANTI-GADELHA, T. ; ROCHA, B. A. M. ; BORGES, J. C. ; FREITAS, B. T. ; CANDURI, Fernanda ; DELATORRE, Plinio ; de azevedo wf ; CAVADA, Benildo S.. Native crystal structure of NO releasing inductive lectin from seeds of the "Canavalia maritima" (ConM) (Código PDB: 2CWM). 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
30. FREITAS, B. T. ; DELATORRE, Plinio ; MORENO, F. B. M. B. ; ROCHA, B. A. M. ; SOUZA, Emmanuel P. ; CANDURI, Fernanda ; CARDOSO, A. L. H. ; SAMPAIO, A. H. ; de azevedo wf ; CAVADA, Benildo S.. Crystal structure of native "Canavalia gladiata" lectin (CGL): a tetrameric ConA-like lectin (Código PDB: 1WUV). 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
31. KRYSTOF, Vladimir ; CANKAR, P. ; HAJDUCH, M. ; de azevedo wf ; PAPRSKAROVA, M. ; ORSAG, M. ; ROLCIK, J. ; LATR, A. ; FISCHER, P. M. ; STRNAD, M.. 4-Arylazo-3,5-diamino-1H-pyrazole CDK inhibitors: SAR study, crystal structure in complex with CDK2, selectivity, and cellular effects (Código PDB: 2CLX). 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
32. DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; FAIM, L. M. ; VASCONCELOS, I. B. ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Structure of shikimate kinase from "Mycobacterium tuberculosis" complexed with ADP and shikimate at 1.9 angstrons of resolution (Código PDB: 2DFN). 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
33. AZEVEDO, WALTER; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine. 2G85: Crystal structure of chorismate synthase from Mycobacterium tuberculosis at 2.22 angstrons of resolution. 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
34. AZEVEDO, WALTER; CAVADA, Benildo S.. 2GSJ: cDNA cloning and 1.75A crystal structure determination of PPL2, a novel chimerolectin from Parkia platycephala seeds exhibiting endochitinolytic activity. 2006. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
35. de azevedo wf. Curso avançado sobre métodos de estudos da estrutura e função de proteínas. 2005. Curso de curta duração ministrado/Outra
36. de azevedo wf. Bioinformática. 2005. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de material didátido on-line
37. CANDURI, Fernanda ; de azevedo wf. Introdução à bioquímica. 2005. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de material didátido on-line
38. de azevedo wf. Cristalografia. 2005. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de material didátido on-line
39. PEREIRA, José Henrique ; OLIVEIRA, Jaim Simões de ; CANDURI, Fernanda ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystal structure of shikimate kinase from mycobacterium tuberculosis in complex with MGADP and shikimic acid (Código PDB: 1WE2). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
40. de azevedo wf; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; BORGES, J. C. ; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, Fernanda ; RAMOS, C. H. I. ; FRAZZON, J. ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of chorismate Synthase from "Mycobacterium tuberculosis" (Código PDB: 1ZTB). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
41. de azevedo wf; KIM, S. H.. Human cyclin-dependent kinase 2 in complex with roscovitine (Código PDB: 2A4L). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
42. OLIVEIRA, Jaim Simões de ; PEREIRA, José Henrique ; RODRIGUES, N. C. ; CANDURI, Fernanda ; BASSO, Luis Augusto ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of wild-type of Enoyl-ACP(CoA) reductase from Mycobacterium tuberculosis (Código PDB: 2AQ8). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
43. OLIVEIRA, Jaim Simões de ; PEREIRA, José Henrique ; RODRIGUES, N. C. ; CANDURI, Fernanda ; SOUZA, O. N. ; BASSO, Luis Augusto ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of isoniazid-resistant I21V Enoyl-ACP(CoA) reductase mutant enzyme from Mycobacterium tuberculosis (Código PDB: 2AQH). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
44. OLIVEIRA, Jaim Simões de ; PEREIRA, José Henrique ; RODRIGUES, N. C. ; CANDURI, Fernanda ; SOUZA, O. N. ; BASSO, Luis Augusto ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of Isoniazid-resistant I47T Enoyl-ACP(CoA) reductase mutant enzyme from Mycobacterium tuberculosis (Código PDB: 2AQI). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
45. OLIVEIRA, Jaim Simões de ; PEREIRA, José Henrique ; RODRIGUES, N. C. ; CANDURI, Fernanda ; SOUZA, O. N. ; BASSO, Luis Augusto ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of Isoniazid-resistant S94A Enoyl-ACP(CoA) reductase mutant enzyme from Mycobacterium tuberculosis (Código PDB: 2AQK). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
46. CAVADA, Benildo S. ; de azevedo wf ; DELATORRE, Plinio ; ROCHA, Bruno Anderson M. ; SOUZA, Emmanuel P. ; GADELHA, C. A. A.. Crystal structure of ConM in complex with trehalose and maltose (Código PDB: 2CY6). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
47. DELATORRE, Plinio ; ROCHA, Bruno Anderson M. ; SOUZA, Emmanuel P. ; GADELHA, C. A. A. ; de azevedo wf ; CAVADA, Benildo S.. The Crystal Structure of Canavalia Maritima Lectin (ConM) in Complex with Trehalose and Maltose (Código PDB: 2CYF). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
48. DELATORRE, Plinio ; ROCHA, Bruno Anderson M. ; SOUZA, Emmanuel P. ; FREITAS, B. T. ; MORENO, F. B. M. B. ; SAMPAIO, A. H. ; de azevedo wf ; CAVADA, Benildo S.. Crystal structure of A lectin from "Canavalia gladiata" seeds complexed with alpha-methyl-mannoside and alpha-aminobutyric acid (Código PDB: 2D7F). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
49. AZEVEDO, WALTER; CAVADA, Benildo S.. 2CWM: Native Crystal Structure of NO releasing inductive lectin from seeds of the Canavalia maritima (ConM). 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
50. AZEVEDO, WALTER; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, F.. 1YRY: Crystal structure of human PNP complexed with MESG. 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
51. AZEVEDO, WALTER; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, F.. 2AQ8: Crystal structure of wild-type of Enoyl-ACP(CoA) reductase from Mycobacterium tuberculosis in complex with NADH. 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
52. AZEVEDO, WALTER; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, F.. 2AQI: Crystal structure of Isoniazid-resistant I47T Enoyl-ACP(CoA) reductase mutant enzyme from Mycobacterium tuberculosis in complex with NADH. 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
53. AZEVEDO, WALTER; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, F.. 2AQH: Crystal structure of Isoniazid-resistant I21V Enoyl-ACP(CoA) reductase mutant enzyme from Mycobacterium tuberculosis in complex with NADH. 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
54. AZEVEDO, WALTER; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, F.. 2AQK: Crystal structure of Isoniazid-resistant S94A Enoyl-ACP(CoA) reductase mutant enzyme from Mycobacterium tuberculosis in complex with NADH. 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
55. AZEVEDO, WALTER; Kim, S-K. 2A4L: Human cyclin-dependent kinase 2 in complex with roscovitine. 2005. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
56. PALMA, Mario Sergio ; de azevedo wf. Fundamentos de análise proteômica-CNPq. 2004. Curso de curta duração ministrado/Extensão
57. de azevedo wf. Bioinformática-Minicurso na Semana da Computação do IBILCE-UNESP. 2004. Curso de curta duração ministrado/Outra
58. de azevedo wf; CANDURI, Fernanda ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; PEREIRA, José Henrique ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; SILVA, R G ; MENDES, Maria Anita ; BASSO, Luis Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of human PNP complexed with guanine (Código PDB: 1V2H). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
59. CANDURI, Fernanda ; SILVA, R G ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystal structure of human PNP complexed with 8-Azaguanine (Código PDB: 1V41). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
60. CANDURI, Fernanda ; SILVA, R G ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago ; de azevedo wf. Crystal Structure of human PNP complexed with 3-deoxyguanosine (Código PDB: 1V45). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
61. de azevedo wf; CANDURI, Fernanda ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; PEREIRA, José Henrique ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; SILVA, R G ; MENDES, Maria Anita ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of human PNP complexed with immucillin H (Código PDB: 1PF7). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
62. CANDURI, Fernanda ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; SILVA, R G ; MENDES, Maria Anita ; BASSO, Luis Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of human purine nucleoside phosphorylase complexed with guanosine (Código PDB: 1RFG). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
63. CANDURI, Fernanda ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; SILVA, R G ; MENDES, Maria Anita ; BASSO, Luis Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Structure of human PNP complexed with DDI (Código PDB: 1V3Q). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
64. CANDURI, Fernanda ; SANTOS, Denis Marangoni dos ; SILVA, Rafael G ; MENDES, Maria Anita ; BASSO, Luis Augusto ; PALMA, Mário Sérgio ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of Human purine nucleoside phosphorylase complexed with inosine (código PDB: 1RCT). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
65. SANTOS, Denis Marangoni dos ; CANDURI, Fernanda ; PEREIRA, José Henrique ; DIAS, Márcio Vinicius Bertacine ; SILVA, Rafael G ; MENDES, Maria Anita ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; de azevedo wf ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of human PNP complexed with acyclovir (Código PDB: 1PWY). 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
66. AZEVEDO, WALTER; PEREIRA, José Henrique ; CANDURI, F.. 1WE2: Crystal structure of shikimate kinase from mycobacterium tuberculosis in complex with MGADP and shikimic acid. 2004. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
67. de azevedo wf; SANTOS, Denis Marangoni dos ; CANDURI, Fernanda ; SANTOS, Giovani Cesar dos ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; SILVA, Rafael G ; PALMA, Mário Sérgio ; BASSO, Luis Augusto ; SANTOS, Diógenes Santiago. Crystal structure of human PNP at 2.3 A resolution (Código PDB: 1M73). 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
68. SEIXAS, F. A. V. ; de azevedo wf ; COLOMBO, M. F.. Crystal structure of human deoxyhemoglobin in absence of any anions (Código PDB: 1KD2). 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
69. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, Fernanda. 1PF7: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PNP COMPLEXED WITH IMMUCILLIN H. 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
70. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, F.. 1V2H: Crystal structure of human PNP complexed with guanine. 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
71. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, F.. 1RCT: Crystal structure of Human purine nucleoside phosphorylase complexed with INOSINE. 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
72. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, F.. 1V3Q: Structure of human PNP complexed with DDI. 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
73. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, F.. 1V41: Crystal structure of human PNP complexed with 8-Azaguanine. 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
74. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, F.. 1V45: Crystal Structure of human PNP complexed with 3-deoxyguanosine. 2003. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
75. de azevedo wf. Bioinformática Estrutural. 2002. Curso de curta duração ministrado/Extensão
76. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, Fernanda. 1M73: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN PNP AT 2.3A RESOLUTION. 2002. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
77. DELATORRE, Plinio ; de azevedo wf. Simulation of electron density maps for two-dimensional crystal structures using mathematica. 2001. Desenvolvimento de material didático ou instrucional - Desenvolvimento de material didátido on-line
78. CANDURI, Fernanda ; TEODORO, L. G. V. L. ; FADEL, Valmir ; LORENZI, C. C. B. ; HIAL, V. ; GOMES, R. A. S. ; RUGGIERO NETO, João ; de azevedo wf. Crystal Structure of Human Uropesin at 2.45 A resolution (Código PDB: 1FLH). 2001. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
79. FADEL, Valmir ; CANDURI, Fernanda ; OLIVIERI, Johnny Rizzieri ; SMARRA, A. L. S. ; COLOMBO, M. F. ; BONILLA-RODRIGUEZ, G. O. ; de azevedo wf. CRYSTAL STRUCTURE OF AQUOMET HEMOGLOBIN-I OF THE MANED WOLF (CHRYSOCYON BRACHYURUS) AT 2.0 RESOLUTION (Código PDB: 1FHJ). 2001. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas
80. AZEVEDO, WALTER; CANDURI, F.. 1FLH: CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN UROPEPSIN AT 2.45 A RESOLUTION. 2000. Depósito de coordenadas atômicas de moléculas biológicas

Produção artística

Total de produção artística (0)

Orientações em andamento

Supervisão de pós-doutorado (0)
Tese de doutorado (1)
1. Gabriela Bitencourt Ferreira. Estudo das Interações Proteína-Ligante por Abordagens de Aprendizado de Máquina. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. Início: 2020.
  Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Dissertação de mestrado (0)
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (0)
Trabalho de conclusão de curso de graduação (0)
Iniciação científica (0)
Orientações de outra natureza (0)

Supervisões e orientações concluídas

Supervisão de pós-doutorado (4)
1. Claudia Elizabeth Thompson. . Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
  Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
2. Ana Luiza Vivan. . Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2007.
  Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
3. Fernanda Canduri. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
  Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
4. Júlio César Borges. . Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
  Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Tese de doutorado (13)

Maurício Boff de Ávila. Modelos Computacionais para previsão de afinidade entre ligantes e proteínas alvos para o desenvolvimento de fármacos. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Silvana da Cunha Russo. O Receptor Canabinoide 1- Desafios no Desenho de Fármacos com Enfoque nas Ferramentas da Bioinformática.. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Rafael Andrade Caceres. Estudo estrutural e de dinâmica molecular de enzimas da via metabólica do ácido chiquímico de Mycobacterium tuberculosis: alvos para o desenvolvimento de drogas anti-tuberculose. Tese (Doutorado em Medicina e Ciências da Saúde.) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Graziela Heberle. Estudo in silico de inibidores de SIRT1. Tese (Doutorado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Fernando Berton Zanchi. DINÂMICA MOLECULAR DA ENZIMAS ENOIL REDUTASE E PURINA NUCLEOSÍDEO FOSFORILASE DE Plasmodium falciparum:SUBSÍDIOS ESTRUTURAS PARA O DESENVOLVIMENTO DE NOVOS FÁRMACOS. Tese (Doutorado em Biologia Experimental) - Universidade Federal de Rondônia, . 2009.
Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Helen Andrade Arcuri. Estudo Estrutural de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2008.
Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Frederico Bruno Mendes Batista Moreno. Estudo Estrutural de Lectinas de Origem Vegetal. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2008.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Plinio Delatorre. Lectinas de Leguminosas: novos enfoques estruturais para velhas moléculas. Tese (Doutorado em Bioquímica Vegetal) - Universidade Federal do Ceará, . 2006.
Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Nelson José Freitas da Silveira. Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Proteínas Alvo do Genoma do "Mycobacterium tuberculosis". Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
José Henrique Pereira. Estudo Estrutural de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico de. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Marcio Vinicius Bertacine Dias. Estudo Estrutural de Enzimas da via Metabólica do Ácido Chiquímico. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2004.
Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Valmir Fadel. Estrutura Tridimensional da Crotamina extraída do Veneno da Cascavel Crotalus durissus terrificus utilizando Ressonância Magnética Nuclear Homonuclear. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2003.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Fernanda Canduri. Estudo Estrutural de Proteinases Aspárticas por Cristalografia de Difração de Raios X. Tese (Doutorado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2001.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Dissertação de mestrado (22)

Rosana da Silva Waszak. Desenvolvimento e Aplicação de Funções Escores Otimizadas para Previsão de Afinidade entre Proteínas e Ligantes. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Camila Rizzotto. Receptor de Canabinoide 2. Novo Alvo Terapêutico para Tratamento da Osteoporose: Uma Análise da Interação com Ligantes Através da Aplicação de Ferramentas da Bioinformática. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Maurício Boff de Ávila. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Nayara Maria Bernhardt Levin. Estudo computacional da interação de inibidores com quinases dependentes de ciclina. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2015.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Fernanda Pretto Moraes. Computação biologicamente inspirada aplicada ao estudo da interação proteína-ligante. Dissertação (Mestrado em Medicina e Ciências da Saúde.) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Carolina Pasa Vianna. Identificação de ligantes da chiquimato quinase de Mycobacterium tuberculosis por docking molecular. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Kelen Beiestorf Rocha. Virtual screening e dinâmica molecular para identificação de inibidores da enzima corismato sintase de Mycobacterium tuberculosis. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Luís Fernando Saraiva Macedo Timmers. Estudo estrutural de alvos para desenho de drogas anti-tuberculose. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Juliane Dors Coracini. Simulação computacional do sistema proteína-ligante. Dissertação (Mestrado em Medicina e Ciências da Saúde.) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
José Renato Panzarini Junior. Modelagem Molecular da Chiquimato Quinase de Mycobacterium leprae. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Rafael Andrade Cáceres. Análise estrutural e computacional das proteínas com domínios ETS e suas interações com o DNA. Dissertação (Mestrado em Biologia Celular e Molecular) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Hewlett Packard. 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Ana Helena Case. Modelagem Molecular da Quinase Dependente de Ciclina 1 Complexada com Inibidores. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Helen Andrade Arcuri. Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo da Via Metabólica do Ácido Chiquímico de "Xylella fastidiosa". Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Diego Oliveira Nolasco da Silva. Estrutura Cristalográfica da Purina Nucleosídeo Fosforilase do. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Marcos Michel de Souza. Estudo Estrutural de Purina Nucleosídeo Fosforilase de. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2005.
Supervisor: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Lisandra Marques Gava. Estudo Estrutural da Purina Nucleosídeo Fosforilase Humana em Complexo com Ligantes. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Patricia Peres. Análise Funcional Integrado com Modelagem Molecular da Hemoglobina Catódica do Peixe Hoplosternum Littorales. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2004.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Renato Tadeu Gaspar. Modelagem Molecular da Quinase Dependente de Ciclina 5 Complexada com Roscovitina. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2003.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Janaína Conrado Lyra da Fonseca. Análise Cristalográfica Preliminar das Estruturas das Hemoglobinas do Peixe Matrinxã (Brycon cephalus). Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2002.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Carla Cristina Biazi Lorenzi. Estudo Estrutural de Mastoparanos Isolados de Vespas Solitárias. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2002.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Valmir Fadel. Estrutura cristalografica da Hemoglobina Isolada do Lobo Guara (Chrysocyon Brachiurus).. Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2000.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Plinio Delatorre. Análise Cristalográfica Preliminar das Hemoglobinas do (Peixe) "Liposarcus anisitsi". Dissertação (Mestrado em Ciências Biomoleculares e Farmacológicas) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior. 2000.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Monografia de conclusão de curso de aperfeiçoamento/especialização (7)

Horizontino Souza dos Santos. Pesquisa de Potenciais Inibidores para a Proteína CDK2 a partir de Banco de dados de Produtos Naturais.. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Richard Rene Pereira. Avaliação de Possíveis Moléculas Inibidoras da Enzima Chiquimato Quinase de Mycobacterium tuberculosis Utilizando Metodologias de Docking Molecular. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Silvana da Cunha Russo.. O Receptor Canabinoide 1. Análise Estrutural com Enfoque no Estudo dos Agonistas Inversos Usando as Ferramentas da Bioinformática.. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Taís Silveira Assmann. Investigação dos Genes Alvos da Família hsa-miR-29-3p e sua Possível Participação na Doença Renal do Diabetes. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Amauri Duarte da Silva. Taba: A Tool to Analyze the Binding Affinity.. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2017.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Karim Ebert Pinedo. Leucemia Linfoide Aguda: Um Estudo Computacional sobre Possíveis Inibidores. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Bioinformática) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2017.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Moises Zotti. Funções escores e termos de energia em estruturas resolvidas por NMR. (Aperfeiçoamento/Especialização em Especialização em Farmacologia e Toxicologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2016.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Trabalho de conclusão de curso de graduação (4)

Tales Ferraz de Paula. Método de Regressão Linear Múltipla Aplicado em Dados Gravimétricos. (Graduação em Física) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Daniela Midori Sirano. LigSac: Software para Análise da Interação Proteína-Ligante. (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2003.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Guilherme Eberhart Jorge. Prot GIF - Ferramenta WEB aplicada à construção de gráficos macromoleculares para publicação e ensino. (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2003.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Hugo Brandão Uchoa. Paralelização nos Processos de modelagem molecular e análise de estruturas terciárias de proteínas. (Graduação em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2003.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Iniciação científica (38)

Joana Retzke Godoy. Estudo de Alvos para Descoberta de Fármacos Contra a COVID-19. (Graduando em Biomedicina) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2020.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Gabriela Bitencourt Ferreira. Estudo da Interação de Ligantes com a Quinase Dependente de Ciclina. Um Alvo para o Desenho de Fármacos contra Câncer.. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2019.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Martina Veit Acosta. Bioinformática como ferramenta para descoberta de fármacos. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Bruna Boldrini de Mattos. Supervised Machine Learning Techniques Applied to the Development of Scoring for Enzymes. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Gabriela Bitencourt Ferreira. Desenvolvimento de Funções Escore para Prever a Afinidade Proteína-Ligante. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2018.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Bruna Boldrini de Mattos. Previsão Computacional da Afinidade de Ligantes por Proteínas. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2017.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Valdiléria de Oliveira Pintro. Supervised machine-learning techniques applied to the development of scoring functions for cyclin-dependent kinases. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2017.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Valdiléria de Oliveira Pintro. Previsão Computacional da Afinidade de Ligantes por Proteínas. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2016.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Gabriela Sehnem Heck. Simulações de docking molecular para quinases. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2016.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Valdiléria de Oliveira Pintro. Análise Estatística de Resultados das Simulações de Docking Molecular para o Sistema Proteína-Ligante. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2015.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Nathália Lemes de Carvalho. Simulações de docking molecular para quinases. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2015.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Mariana Morrone Xavier. Simulação computacional do sistema proteína-ligante. Estudo da quinase dependente de ciclina 2. (Graduando em Medicina) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Maurício Boff de Ávila. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Karen Letícia Canedo Rohde. Estudo computacional do sistema proteína-ligante. (Graduando em Ciências Biológicas) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2012.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Bianca Villavicencio. Computação biologicamente inspirada aplicada ao estudo da interação proteína-ligante. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Kaluti Rossi de Martini Moraes. Desenvolvimento de um Modelo Computacional para Avaliação da Interação Proteína-Ligante. (Graduando em Física Médica) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, FUNDACAO DE AMPARO A PESQUISA DO ESTADO DO RIO GRANDE DO SUL. 2011.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Luciele Gonzaga Ribeiro. Estudo da interação proteína-ligante por meio de dinâmica molecular. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Eduarda Ozório Pantoja. Uso de abordagens in silico para identificação de inibidores da enzima acetilcolina esterase (EC 3.1.1.7). (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2010.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Ivaní Pauli. Estudo estrutural da proteína purina nucleosídeo fosforilase humana. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2009.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Luís Fernado Saraiva Macedo Timmers. Estudo estrutural da hipoxantina-guanina fosforibosiltransferase e da adenina fosforibosiltransferase de Mycobacterium tuberculosis. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2009.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Patrícia Cardoso Perez. Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo da CDK3 humana. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2007.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Raquel Dias. Dinâmica Molecular de peptídeos tóxicos. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2007.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Guy Barros Barcellos. Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico de. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Priscila Ansiliero Madruga. Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico de Bacillus anthracis.. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Daiane Borba de Lima. Bioinformática Estrutural Aplicada ao Estudo de Enzimas da Via Metabólica do Ácido Chiquímico de Bacillus anthracis.. (Graduando em Biologia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Sarah Ledur Selbach. Bioinformática estrutural aplicada ao estudo da interação de inibidores com a CDK1 humana. (Graduando em Farmácia) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, . 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Guilherme de Quarnieri de Lima. Dinâmica molecular de peptídeos tóxicos. (Graduando em Física Médica) - Pontifícia Universidade Católica do Rio Grande do Sul, Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico. 2006.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Brianna Bosch dos Santos. Cristalização e Análise Preliminar de Dados de Difração de Raios X da Corismato Sintase de. (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Lívia Maria Faim. Cristalização e Análise Preliminar de Dados de Difração de Raios X da Chiquimato Quinase de. (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Joane Kathelen Rodrigues Rustiguel. Coleta de Difração de Raios X e substituição molecular da lectina de. (Graduando em Física Biológica) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Alexandre Augusto Caramanti Coconesi. Bravo-Xplor. (Graduando em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Nathalia de Campos Rodrigues. Cristalização e análise preliminar dos dados de difração de raios X da InhA de "Mycobacterium tuberculosis". (Graduando em Biologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Nelson Antônio de Oliveira. Biolinux-BR. (Graduando em Bacharelado Em Ciência da Computação) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Carlos Eduardo Bonalumi. Docking Geométrico em Clusters. (Graduando em Matemática) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, . 2005.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Janaina Rosa Cortinóz. Cristalização e análise preliminar de dados por difração de raios X de Purina Nucleosídeo Fosforilase de. (Graduando em Biologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 2004.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Adriana Cristiane Marques Permigiani. Modelagem molecular de CDKs. (Graduando em Física) - Centro Universitário de Votuporanga, . 2004.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Carla Cristina Biazi Lorenzi. Cristalização e análise preliminar dos dados de difração de raios X da protease aspártica urinária humana. (Graduando em Biologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 1999.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Marcia Dellamano. Cristalização e análise preliminar dos dados de difração de raios X da hemoglobina do peixe Prochilodus lineatus.. (Graduando em Biologia) - Universidade Estadual Paulista Júlio de Mesquita Filho, Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo. 1999.
Orientador: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Orientações de outra natureza (0)

Projetos de pesquisa

Total de projetos de pesquisa (3)

2023-Atual. SFSXplorer (Scoring Function Space Explorer)
Descrição: SFSXplorer (Scoring Function Space Explorer) is a Python package to explore the concept of Scoring Function Space (SFS). We can explore the SFS to build a computational model targeted to a specific protein system (targeted-scoring function). SFSXplorer employs binding affinity data and protein-ligand structures (docked or crystallographic) to train machine learning models to predict binding affinity. We base this SFS exploration on a scoring function with variable energy terms. This scoring function is a polynomial equation with terms accounting for van der Waals, hydrogen bonds, electrostatic, desolvation entropy, and torsional contributions. For the hydrogen-bond energy term, we do not focus on 12/10 potential only. SFSXplorer implements an n/m potential equation. We have the same flexibility for van der Waals terms. SFSXplorer calculates energy terms varying the exponents n and m. For electrostatic potential, we modify the permittivity function. We also have a flexible expression for the desolvation entropy term. We account for the torsional energy by employing the standard potential based on the number of torsion angles. Then, we may choose the set of energy terms with the best predictive performance. We have the flexibility for energy terms making available unexplored regions of the SFS. Dr. Walter F. de Azevedo Jr. proposed the initial idea of SFSXplorer, which now has an international team of scientists participating in its development and testing of SFSXplorer.GitHub: https://github.com/azevedolab/SFSXplorer#readme. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Walter Filgueira de Azevedo Junior - Coordenador / Fernanda Canduri - Integrante / Nelson José Freitas da Silveira - Integrante / Amauri Duarte da Silva - Integrante / GONZÁLEZ-VERGARA, ENRIQUE - Integrante / VILLARREAL, MARCOS A. - Integrante / QUIROGA, RODRIGO - Integrante / POROIKOV, VLADIMIR - Integrante / TARASOVA, OLGA - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T & A: 3
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
2023-Atual. Taba (Tool to Analyze the Binding Affinity)
Descrição: Taba (Tool to Analyze the Binding Affinity) generates scoring functions to predict binding affinity based on the atomic coordinates of a protein-ligand complex. It employs a polynomial equation where the terms are mass-spring potentials. Taba calculates average interatomic distances and takes them as equilibrium distances for a mass-spring potential. The mass-spring potential equation and the equilibrium constants for each pair of atoms compose the Taba Force Field (TFF). We are currently updating Taba and expect to release a new version of Taba in 2025.GitHub: https://github.com/azevedolab/taba#readme. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Walter Filgueira de Azevedo Junior - Coordenador / Nelson José Freitas da Silveira - Integrante / Fernanda Canduri - Integrante / Amauri Duarte da Silva - Integrante / GONZÁLEZ-VERGARA, ENRIQUE - Integrante / VILLARREAL, MARCOS A. - Integrante / QUIROGA, RODRIGO - Integrante / POROIKOV, VLADIMIR - Integrante / TARASOVA, OLGA - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T & A: 3
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
2023-Atual. SAnDReS 2.0 (Statistical Analysis of Docking Results and Scoring functions)
Descrição: SAnDReS 2.0 (Statistical Analysis of Docking Results and Scoring functions) brings advanced computational tools for protein-ligand docking simulation and machine-learning modeling. We have AutoDock Vina (version 1.2) as a docking engine. Also, SAnDReS 2.0 has 54 regression methods implemented using Scikit-Learn, which allows us to explore the Scoring Function Space (SFS) concept. This exploration of the SFS permits us to have an adequate machine learning model for a targeted protein system. This approach creates computational models with superior predictive performance compared with classical scoring functions (also known as universal scoring functions). SAnDReS aims to merge the holistic view of systems biology with machine-learning methods to contribute to drug discovery projects. Dr. Walter F. de Azevedo Jr. proposed the initial idea of SAnDReS in 2016, which now has an international team of scientists participating in its development and testing.Link: https://github.com/azevedolab/sandresHow to Cite SAnDReS 2.0de Azevedo WF Jr, Quiroga R, Villarreal MA, da Silveira NJF, Bitencourt-Ferreira G, da Silva AD, Veit-Acosta M, Oliveira PR, Tutone M, Biziukova N, Poroikov V, Tarasova O, Baud S. SAnDReS 2.0: Development of machine-learning models to explore the scoring function space. J Comput Chem. 2024; 45(27): 23332346.SAnDReS 2.0 has the contribution of researchers from six countries and ten different affiliations.GitHub: https://github.com/azevedolab/sandres#readme. Situação: Em andamento; Natureza: Pesquisa. Alunos envolvidos: Doutorado: (1) . Integrantes: Walter Filgueira de Azevedo Junior - Coordenador / Fernanda Canduri - Integrante / Nelson José Freitas da Silveira - Integrante / Amauri Duarte da Silva - Integrante / VILLARREAL, MARCOS A. - Integrante / QUIROGA, RODRIGO - Integrante / POROIKOV, VLADIMIR - Integrante / TARASOVA, OLGA - Integrante. Financiador(es): Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico - Bolsa. Número de produções C, T & A: 4
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.

Prêmios e títulos

Total de prêmios e títulos (7)

Most influential researchers in the world according to a database created by Journal Plos Biology (https://elsevier.digitalcommonsdata.com/datasets/btchxktzyw/7), Elsevier-Plos Biology.. 2024.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Most influential researchers in the world according to a database created by Journal Plos Biology (https://elsevier.digitalcommonsdata.com/datasets/btchxktzyw/6), Elsevier-Plos Biology.. 2023.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Most influential researchers in the world according to a database created by Journal Plos Biology (https://elsevier.digitalcommonsdata.com/datasets/btchxktzyw/4), Elsevier-Plos Biology.. 2022.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Keynote lecture: Harnessing Machine Learning for Drug Discovery., XXVIII Symposium on Bioinformatics and Computer-Aided Drug Discovery.. 2022.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Most influential researchers in the world according to a database created by Journal Plos Biology (https://elsevier.digitalcommonsdata.com/datasets/btchxktzyw/3), Elsevier-Plos Biology.. 2021.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Most influential researchers in the world according to a database created by Journal Plos Biology (https://doi.org/10.1371/journal.pbio.300091, Journal of PLOS Biology.. 2020.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.
Elite de Tecnologia da Revista Info-Exame 2005. Indicado entre os 10 professores universitários de destaque na área de informática., Revista InfoExame.. 2005.
Membro: Walter Filgueira de Azevedo Junior.

Participação em eventos

Total de participação em eventos (22)

XXXV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular-SBBq. Structural Basis for Inhibition of CDK3 by Roscovitine. 2006. (Congresso).
I Semana Acadêmica Interdisciplinar.Structural Bioinformatics. Palestra ministrada na I Semana Acadêmica Interdisciplinar - Faculdade de Biociências-PUCRS. 2005. (Seminário).
XXXIV Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular-SBBq. Structural models of shikimate pathway. 2005. (Congresso).
XIV Reunião de Usuários do LNLS. Structural Basis for Inhibition of Human PNP by Immucillin-H. 2004. (Congresso).
XXXIII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Crystal Structure of Human PNP in Complex with Ligands. 2004. (Congresso).
Semana da Computação-2003.Bioinformática Estrutural em Cluster Beowulf. Aplicações da Computação na Era Pós- Genômica. 2003. (Seminário).
XXVI Congresso Paulo Leal Ferreira. Palestra com título Bioinformática. 2003. (Congresso).
XXXII Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Quaternary Structure Evaluation pf Human PNP in Solution Through SAXS. 2003. (Congresso).
Congresso da Rede Nacional de Tuberculose. Estudo Estrutural de Enzimas Alvo para Desenho de Drogas. Rede Nacional de Tuberculose. 2002. (Congresso).
II Workshop de Informática do Sul de Minas - WISM´2002. Bioinformática. 2002. (Congresso).
I Mostra de Tecnologia da UNESP. Planejamento, Construção Adaptação de Clusters Beowulf para Problemas de Bioinformática; Desenvolvimento de Ferramentas de Bioinformática em Clusters Beowulf.. 2002. (Congresso).
Workshop on Molecular Modeling in Biophysics - Methods and Applications - Sattelite Meeting IUPAB International Biophysics Congress. Comparative Modelling Using Modeller. 2002. (Congresso).
XXXI Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Conformational Analysis of Eumenine Mastoparans Isolated from the Solitary Wasp Anterhynchium Flavomarginatum micado. 2002. (Congresso).
II Workshop Temático do Center for Applied Toxinology-CAT. Modelagem Molecular de Toxinas.. 2001. (Congresso).
XV Symposium of the Protein Society. Functional and Crystallographic Evidence for Cooperative Oxigen Binding without Quaternary Structural Changes. 2001. (Congresso).
XXX Reunião Anual da Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Analysis and Molecular Modeling of Anoplin a New Class of Amphiphilic Alpha-Helical Peptide from Solitary Wasp Venom. 2001. (Congresso).
Congresso de Biofísica do Cone Sul. Beowulf and Mosix Class Supercomputers Applied to Computational Biophysics.. 2000. (Congresso).
VI Simpósio da Sociedade Brasileira de Toxinologia-SBT.Structural Analysisnof an Eumenine Mastoparan Toxin: A New Class of Mast Cell Degranulating Peptide from Wasp Venom.. 2000. (Simpósio).
XV Reunião da Sociedade Brasileira de Cristalografia. Crystallization of HR-1 a synthetic mastoparan. 2000. (Congresso).
VIII Workshop Anual de Usuários do LNLS. Crystal Structure of Myotoxin-II: A Myotoxic Phospholipase A2-Homologue from Bothrops moojeni Venom. 1997. (Congresso).
XV Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Estrutura cristalina do trans-dicloro[(trietilfosfina)(2-metilsulfinil) pirina]Pl. 1992. (Congresso).
XIII Encontro Nacional de Física da Matéria Condensada. Estudo da porosidade do caulim e metacaulim. 1990. (Congresso).

Organização de eventos

Total de organização de eventos (2)

DE AZEVEDO, WF.. Curso de Cristalografia de Proteínas-FIOCRUZ/Salvador-BA. 2007. (Outro).. . 0.
DE AZEVEDO, WF.; PALMA, Mário Sérgio. II Workshop temático do Center for Applied Toxinology(CAT). Análise Estrutural e Funcional de Peptídeos Tóxicos. 2001. Congresso

Lista de colaborações

Colaborações endôgenas (1)

Walter Filgueira de Azevedo Junior ⇔ Ihosvany Camps Rodríguez (1.0)
FREITAS, POLIANY G. ; ELIAS, THIAGO C. ; PINTO, ICARO A. ; COSTA, LUCIANO T. ; DE CARVALHO, PAULO V.S.D. ; DE Q. OMOTE, DANIEL ; CAMPS, IHOSVANY ; ISHIKAWA, TATI ; ARCURI, HELEN A. ; VINGA, SUSANA ; OLIVEIRA, ARLINDO L. ; JUNIOR, WALTER F.A. ; DA SILVEIRA, NELSON J.F.. Computational Approach to the Discovery of Phytochemical Molecules with Therapeutic Potential Targets to the PKCZ protein. Letters in Drug Design & Discovery. v. 15, p. 488-499, issn: 1570-1808, 2018. Qualis: B1

(*) Relatório criado com produções desde 1914 até 2114
Data de processamento: 21/07/2025 15:13:21

Relatório gerado por scriptLattes V9. Os resultados podem ser afetados por possíveis falhas decorrentes de inconsistências no preenchimento dos Currículos Lattes. E-mail de contato: icamps@unifal-mg.edu.br